La parte principal de la configuración del sistema se realiza  en el submenú Configuración. Estesubmenú se divide en seis pestañas, cada una de ellas es responsable de la configuración de determinadas partes del sistema.

Se pueden distinguir las siguientes etapas básicas de la configuración del sistema:

1. Configuración del dominio Axxon.
2. Conexión y configuración del equipo.
3. Configuración de archivos.
4. Configuración de pantallas del mapa interactivo.
5. Configuración de cargos y usuarios.